Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms