Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NIFKQ9BYG3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms