Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms