Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms