Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR3CQ9BUI4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms