Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MESP1Q9BRJ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms