Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSF3RQ99062 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms