Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms