Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC9Q96Q05 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms