Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
C9orf85Q96MD7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C9orf85Q96MD7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms