Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC7Q96M83 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC7Q96M83 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms