Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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