Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAPZA3Q96KX2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms