Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms