Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLIP3Q96DZ5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP3Q96DZ5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms