Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms