Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKD1Q969G9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NKD1Q969G9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms