Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHF3Q92576 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms