Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBXN4Q92575 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms