Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMPDL3BQ92485 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms