Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERVK_113Q902F9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms