Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ZCCHC13Q8WW36 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms