Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM41Q8WV44 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM41Q8WV44 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms