Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms