Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMCO5AQ8N6Q1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCO5AQ8N6Q1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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