Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms