Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDZD4Q76G19 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms