Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms