Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUSD1Q6UWL2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms