Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF7Q6Q0C0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms