Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-223ENST00000522068 573 ntTSL 46.99□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 CARD8-209ENST00000518979 3533 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-216ENST00000520153 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-208ENST00000518622 5233 ntTSL 1 (best)6.38□□□□□ -1.393e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-229ENST00000523750 633 ntTSL 35.93□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.483e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.513e-8■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.973e-8■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 MRPS7-202ENST00000577767 566 ntTSL 20.42□□□□□ -2.344e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 INTS8-211ENST00000521860 548 ntTSL 5-0.63□□□□□ -2.511e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 PNKP-223ENST00000629179 811 ntTSL 412.21□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CRELD1-208ENST00000467713 540 ntTSL 210.69□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 28.3
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PRPF8Q6P2Q9 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 28.3
PRPF8Q6P2Q9 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-7■■■■■ 28.3
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