Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCTN3Q6NUS6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms