Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01545Q5VT33 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01545Q5VT33 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms