Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIF1Q5UIP0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIF1Q5UIP0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms