Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM164Q5U3C3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms