Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LGSNQ5TDP6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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