Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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