Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF2Q5BJF6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms