Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COBLL1Q53SF7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms