Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms