Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms