Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM259Q4ZIN3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM259Q4ZIN3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms