Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00303Q3SY05 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms