Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP21-3Q3LHN1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms