Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF1Q3BBV0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms