Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL40Q2TBA0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms