Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GEN1Q17RS7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms