Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LAMA3Q16787 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAMA3Q16787 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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