Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP2B3Q16720 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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