Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIF1AQ16665 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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